Протипоказання магнітотерапії стосуються:
- кровотеч і відкритих ран (суглоба, тканин, кістки);
- гіпотонії (низький артеріальний тиск);
- тромбофлебіту;
- серцевої недостатності, дестабілізації кардіорітма;
- присутності кардіостимулятора
- активного туберкульозу;
- порушень психіки;
- загострень інфекційні захворювань і т. д.