На глинистих і підзолистих грунтах основна маса кореневої системи яблуні розташовується на глибині від 20 до 60 см, а на алювіально-лугових, багатих поживними речовинами грунтах – глибше. поодинокі коріння у яблунь проникають на глибину до 4 м, всмоктувальні знаходяться в основному поблизу поверхні грунту.